リキッドバイオプシーは、低侵襲にリアルタイムの疾患生物学へアクセスできる手法ですが、多くの既存技術は遺伝情報のみに焦点を当てており、循環ヌクレオソームにコードされた制御情報を十分に捉えていません。

EpiFinder™ cNUCは、血漿および血清から直接、マルチプレックスなエピゲノムプロファイリングを可能にする業界初の製品であり、疾患状態、進行、治療応答に関連するエピジェネティックシグネチャーに基づき、バイオマーカーに関する有用な洞察を提供します。

EpiFinder™ cNUC
プロファイリング方法	ゲノムワイド
サンプルタイプ	血漿または血清
サンプル数 × ターゲット数	24 サンプル × 6 ターゲット
ターゲット種類	ヒストン翻訳後修飾 hPTMs DNAメチル化 DNAme
1サンプルあたり開始材料量	200μL〜1mL
シーケンス深度	500万〜3000万リード/サンプル/免疫沈降

※1mL未満の解析には、Epigenica社の受託解析サービスの利用を推奨いたします。

最適化されたプロトコールにより、3日間・ハンズオンタイム約14時間のプール型のワークフローは、あらゆる研究者にとって実施しやすい設計となっています。

  

サンプルはバーコーディングおよびプールされ、単一ランで最大24の血漿または血清サンプルを並列処理できます。最大6種類の検証済み抗体とインプットコントロールを用いたマルチプレックス免疫沈降を行い、その後ライブラリを調製し、サンプルあたり最大7種類のIllumina対応シーケンスライブラリーを作製します。

• 複数エピジェネティックマークの並列プロファイリング
  単一のワークフローで、複数の検証済みエピジェネティックマークを同時に解析可能であり、さまざまな治療領域に対応しています。
• ヌクレオソーム抽出は不要
  血漿および血清中のヌクレオソームを直接解析することで、生物学的完全性を保持しつつ、プロセスの簡略化とコスト・時間の削減を実現します。
• バイアスのないメチロームバイオマーカー探索
  サンプルから直接、ゲノムワイドのDNAメチル化シグネチャーを同定し、メチロームバイオマーカーの発見を加速します。
• サンプルあたりのコスト削減
  マルチプレックス化により、実験コストおよびシーケンスコストを大幅に低減します。

マーク※	関連するゲノム特徴
H3K4me3	活性と二価性（bivalent）プロモーター
H3K27me3	条件的に抑制された（ポリコーム依存的）プロモーターおよび遺伝子領域
H3K9me3	恒常的に抑制された領域およびリピート配列
H3K36me3	活発に転写されている遺伝子領域
H3K27ac	エンハンサーと活性化プロモーター
DNAme（5mC）	CpGアイランドにおけるDNAメチル化 クロマチンアクセス、遺伝子を抑制

※すべての検証済みマークに対応する抗体およびキャプチャータンパク質は、本キットに含まれています。

健常ドナー由来の血漿サンプルにおいて、EpiFinder™ cNUCを用いた単一ランにより、5種類の主要な制御性ヒストン修飾とDNAメチル化の並列プロファイリングを示しています。
   

活性領域、発生過程で抑制される領域、および構成的に抑制された領域において、それぞれ異なるエンリッチメントパターンが観察され、血液サンプルから直接取得された生物学的に一貫したクロマチンシグネチャーを示しています。

製品名	型式番号
EpiFinder™ cNUCキット	30100
H3K9me3抗体 -10μg	80100-10
H3K4me3抗体 -10μg	80101-10
H3K27me3抗体 -10μg	80102-10
H3K36me3抗体 -10μg	80103-10
H3K9ac抗体 -10μg	80104-10
H3K27ac抗体 -10μg	80105-10
H3K4ac抗体 -10μg	80106-10

• 『リキッドバイオプシーにおけるエピジェネティックな側面を解明』
  
  

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• 『EpiFinder™ cNUCを用いた大腸がんにおける循環ヌクレオソームのマルチプレックス・エピジェネティックプロファイリング』
  
  

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