 劣化したサンプル（FFPE）の救済 |
iconPCRのリアルタイム定量とオートノーマライゼーションにより、サンプルの品質によらず、⾼品質なライブラリー調製が可能になります。
幅広い品質のDNAサンプルから、従来のワークフローまたはiconPCRを⽤いたワークフローにより、ライブラリー調製を⾏いました。従来のワークフローでは、サンプルの品質により収量に差を認めましたが、iconPCRを⽤いたワークフローではすべてのサンプルを均⼀に増幅したことが確認できました。これにより、⾼品質サンプルでは過剰増幅のリスクが、低品質サンプルでは過少増幅のリスクが排除され、FFPEサンプルから抽出したDNA（もしくはRNA）を⽤いたNGSライブラリー調製の信頼性がより⾼く、効率的になります。
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| シングルセル RNA-seq |
iconPCRはサンプルの定量と最終的なノーマライゼーションステップを省略し、よりシンプルなワークフローで⾼品質のライブラリーを⽣成します。
（左図）従来のワークフローまたはiconPCRを⽤いたワークフローにより調製されたライブラリーは、遺伝⼦の検出数および分⼦バーコード（UMI）の検出数において同等の結果を⽰しました。また、ミトコンドリアの割合（% mito）などの重要な品質指標に変化は認めませんでした。すべてのサンプルにおいて、細胞あたりの平均リード数と細胞あたりの平均UMI数および細胞あたりの平均遺伝⼦数の間に強い相関を認めました。これは遺伝⼦およびUMI数の違いはサンプル間のシーケンス深度の違いによるものであることを⽰しています。（右図）すべてのサンプルのクラスタリングにおいて、ライブラリー調製のワークフロー による違いを認めず、ワークフローの変更がデータ品質に悪影響を与えないこ とが⽰されました。
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| 土壌サンプルのメタゲノミクス解析 |
iconPCRは多様なサンプルを⾃動的にノーマライズし、キメラを減少させ、プーリングを効率化します。
メタゲノミクスのための⼟壌サンプルで、16S rRNAのV1-V9領域（約1,500 bp）をカバーするロングリードシーケンスを⾏いました。それぞれの⾊は独⽴した細菌種を表しています。iconPCRを⽤いたワークフローにより調製されたライブラリー（右図）は、サンプル中に豊富に含まれる細菌種の過剰増幅を防ぐことで、従来のワークフローにより調製されたライブラリー（左図）と⽐べてはるかに正確な多様性レベル（Shannonの多様度指数（Shannon Diversity Index）が2倍に増加）を⽰しています。
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