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ResolveDNA®シングルセル全ゲノム増幅キット 

ResolveDNA ® シングルセル全ゲノム増幅キット
Primary Template-directed Amplification(PTA)法でシングルセルあるいは微量DNAから高いカバレッジと均一性で全ゲノム増幅が可能です。
ResolveDNAキットは、シーケンスコストの増加や複雑なデータ解析につながる、シングルセルゲノミクスにおける低いカバレッジや均一性という固有の課題を克服します。
このPTA法ベースのキットで採用されている制御された反応パラメーターは、業界をリードする均一性と精度で、シングルセルや微量DNAインプットサンプルの95%以上のゲノムを再現性よく回収することを可能にします。

全ゲノム・トランスクリプトーム増幅にはResolveOMEキットをご利用ください。



特長

  • シングルセルからバルクサンプルの品質でゲノムカバレッジが得られます
  • アレルのドロップアウトやバイアスが既存の全ゲノム増幅法と比較して著しく低いです
  • 一次テンプレート特異的な増幅により、97%以上のリードがヒトゲノムにマッピングされます
  • 最大384反応のキットで、低コストでスケーラブルなWGAアプローチが可能です
  • わずか30分のハンズオンタイムで実施可能な簡単でユーザーフレンドリーなワークフローで、自動化も可能です


Primary Template-directed Amplification(PTA)法についてはこちらをご覧ください。

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ワークフロー

  • 単離した細胞からシーケンシングライブラリ調製までわずか8時間、ハンズオンタイムは30分です
  • 自動と手動、両方の反応セットアップに最適化されています
  • 対応サンプル
    新鮮/凍結の生細胞 哺乳類細胞、核、微生物、マイクロバイオーム、DNA (4 pg~10 ng)
    その他のサンプルはご相談ください
  • ターゲットキャプチャ技術と組み合わせることも可能です

    ワークフロー図
    細胞の単離

    細胞の溶解

    全ゲノム増幅
    ライブラリ調製
    次世代シーケンシング(NGS)
    データ解析


    ※ ResolveDNAシングルセル全ゲノム増幅コアキットには、「Cell Lysis」から「Library Preparation」までのワークフローを実施するための試薬が含まれます



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キット構成品

  • ResolveDNA シングルセル全ゲノム増幅コアキット - 96 wellフォーマット用
    商品名 型式
    ResolveDNA シングルセル全ゲノム増幅コアキット, 96 rxns, with Adapter Set A

    <構成品>
    100954

    <保管条件>
    ResolveDNA Whole Genome Amplification Kit v2.0 100545 -20℃ 
    ResolveDNA Universal Library Prep kit 96 rxns 100691 -20℃
    Single Use Library AdapterーSet A、96 rxns 100940 -20℃
    ResolveDNA Bead Purification kit 100182 4℃  毒 


  • ResolveDNA シングルセル全ゲノム増幅コアキット - 384 wellフォーマット用(要自動化装置)
    商品名 型式
    ResolveDNA シングルセル全ゲノム増幅コアキット, 384 rxns, with Adapter Set W

    <構成品>
    100955

    <保管条件>
    ResolveDNA Whole Genome Amplification Kit v2.0 100545 -20℃ 
    ResolveDNA Universal Library Prep kit 384 rxns 100953 -20℃
    Single Use Library AdapterーSet W、384 rxns 100948 -20℃
    ResolveDNA Bead Purification kit 100182 4℃  毒 
    ※ キット構成品単品でのお取り扱いもございます。
    ※ 4キット入りのバルク販売もございます。


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アプリケーションノート・テクニカルノート

『正確なシングルセル解析ががん細胞の不均一性を解明する鍵となる』
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『ResolveDNA全ゲノム増幅を利用した単一ニューロンでの体細胞SNVとIndelの解析』
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『ResolveDNAキットを用いたシングルセルゲノム研究とターゲットエンリッチメントとの統合』
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『マイクロバイオームからのResolveDNAを用いたシングルバクテリアのゲノム解析』
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References

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BaseJumper® マルチオミクスデータ解析プラットフォーム

BaseJumperイメージ BaseJumperプラットフォームは、ResolveDNAあるいはResolveOMEで得られたデータのバイオインフォマティクス分析とインタラクティブな視覚化を大規模に実施するために設計されています。シングルセル全体のマルチオミクスデータの解析には、分子的特徴の相互作用を理解するための結果の整理とマッピングが必要です。BaseJumper は、計算から結果の解釈に時間をシフトさせ、スピードと使いやすさを提供します。


  • 解析パイプライン
    • 二次解析
      DNA-QC, Whole Genome Sequencing, Whole Exome Sequencing, Expression
    • 三次解析
      Copy Number Variant (CNV), Structure Variant (SV), TMB, Variant Annotation, RNA Variant Calling
      など

ラインナップ
  • BaseJumper Cloud
    無料でご利用いただけるクラウドベースのバイオインフォマティクスプラットフォームです。シーケンスリードのクオリティチェックおよびトランスクリプトーム解析が可能です。
  • BaseJumper Local
    コンピューター/コンピュータークラスターにインストールして使用するコマンドラインベースのプラットフォームです。BaseJumperのすべての解析コンポーネントがご使用いただけます。
    ※Sentieonライセンスが必要です。
  • BaseJumper Services
    ご要望に応じてBioSkryb社のバイオインフォマティクスチームが解析を実施します。

※BaseJumperは研究用です。健康解釈のような臨床的な用途や、人間の病気の診断や治療の補助を目的としたものではありません。


テクニカルノート

『どこからでも可能な迅速なマルチオーム解析とインタラクティブな可視化』
テクニカルノートのダウンロード リンク


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この製品のメーカー

  • BioSkryb Genomics, Inc.
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