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ターゲットキャプチャキット myBaits Custom RNA-Seq

ターゲットキャプチャキット myBaits Custom RNA-Seq

RNASeqアプリケーション用に調整されたターゲットキャプチャキット

RNASeqアプリケーション用に調整されたターゲットキャプチャキットです。迅速かつ選択的なターゲットエンリッチメントにより、費用対効果の高い、次世代シーケンシングを提供します。

サンプル中のTotal RNAの次世代シーケンス(RNA-Seq)は遺伝子発現のシグナルを直接調べるための有効な方法です。しかしながら、Total RNA-Seqの前に、有益でない転写産物を除去する方法(例: rRNA removal)を用いても、Total RNA Seqサンプルは非常に複雑で、関心のある希少な転写産物のシグナルを解明するためには、ディープシーケンシングが必要になります。

myBaits Custom RNA-Seqハイブリダイゼーションキットは、関心のある遺伝子のみにカスタマイズしたエンリッチメントパネルを簡単に設計でき、RNA-Seqの前に複雑な次世代シーケンスライブラリからターゲットのみを濃縮するために使用できます。ハイブリダイーゼションキャプチャ法は、遺伝子発現シグナルレベルを損うことなく、サンプルあたりのシーケンスコストを大幅に削減します。

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高精度・再現性のmyBaits cDNA Renseq エンリッチメント



A: 散布図はcDNA RenSeqとディープシーケンシングしたRNA-SeqライブラリのNLR遺伝子のlog2リードカウントの間に高い相関関係があることを示しています。
B:異なる組織における遺伝子発現の階層的クラスタリングを示しています。

Steurnagel et.al.(2018, BioRxiv)で解析されました詳細は、アプリケーションノート をご覧ください。

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希少転写産物の高いカバレッジのシーケンスが可能



myBaits Custom RNA-Seqキャプチャと増加したカバレッジ、高い信頼性により、PcdhαオルタナティブエクソンのアンチセンスRNA転写産物の高いレベルが明らかになりました。
オレンジ色のバー: Pcdh αとγクラスターに設計されたmyBaits(プローブ)を示しています。
この図は、Canzio et.al.(2019, Cell)に基づいています。
詳細は、Publication note をご覧ください。

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myBaits RNA-Seq 病原体キャプチャの高い相関と再現性



散布図は、濃縮、および濃縮なしの病原体転写物ライブラリのリードカウント(3つの複製のlog2リードカウント)に高い相関があることを示しています。リードは、0.3%相当する病原体RNAを添加した宿主サンプルのRNAから取得しました。

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マニュアル、Safety Data Sheet

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  • Arbor Biosciences
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