• 一つの細胞から全ゲノムと全長mRNAトランスクリプトームライブラリが構築できます
• 細胞分離からシーケンシングライブラリまで、一日で調製可能です
• ResolveDNAと同じ品質のWGAパフォーマンスを示します：PTA法は従来のMultiple Displacement Amplification(MDA)法と比較して、増幅アーティファクトを減少させ、97%以上のゲノム増幅カバレッジを示し、アレルバランスを改善します
  
  
  
  ResolveOMEシングルセル全ゲノム・トランスクリプトーム増幅キットでアクセスできるデータの幅広さ：ドロップレットベースのDNA-seqや3’ RNA-seqと異なり、ResolveOMEのワークフローでは、ゲノム、mRNAトランスクリプトーム、タンパク質配列の変化による影響の推測を包括的な観点で解析することができます。ResolveOMEキットは、多くのモダリティ(セグメント数)をサポートし、通常、個々のモダリティにおいてより完全なカバレッジを提供します。ドロップレットベースの技術はスループットに優れますが、ResolveOMEキットはインプット細胞のかなり高い割合(3倍以上)からデータを得ることができます。データの目盛は、定量的、定性的な社内データと公表データより作成しました。
  
  
• ResolveOME紹介動画 (3:18)
  

• 全ゲノムおよび全長mRNAの網羅により、遺伝子発現と転写物構造におけるゲノム変異(すべての主要なバリアントクラス)の意義が明らかになり、構造、機能および活性に重大な影響を与える可能性のある推定タンパク質配列のわずかな変化を明らかにできます。
• 同一の細胞からDNAとRNAを解析するための統一されたワークフローにより、ソース材料を分けたり、データセット間の解釈の必要性を排除します。
• 全トランスクリプトーム・ワークフローは、ドロップレットベースのシングルセルRNAシーケンスに比べてRNA解析を強化し、全転写物のRNA-seq、スプライシングとアイソフォームの検出、遺伝子融合の検出を可能にします。

• 単離した同一の細胞からmRNAの逆転写および全ゲノム増幅を連続で行います
• 細胞分離からシーケンシングライブラリまで、一日で調製可能です
• 対応サンプル
  新鮮/凍結の生細胞 哺乳類細胞
  その他のサンプルはご相談ください。

	細胞の単離
	細胞質の溶解後、オリゴdTプライマーを 用いたmRNAの逆転写
	核の溶解
	PTA法による全ゲノム増幅
	cDNAとゲノムDNAの分離
	cDNAの増幅
	cDNA/DNAライブラリの調製
	次世代シーケンシング
	データ解析/解釈

• ResolveOME シングルセル全ゲノム・トランスクリプトーム増幅コアキット
  

  商品名		型式
  ResolveOME シングルセル全ゲノム・トランスクリプトーム増幅コアキット ＜構成品＞		100956 ＜保管条件＞
  ResolveOME Box 1, 96 Rxns	100768	-20℃ 劇
  ResolveOME Box 2, 96 Rxns	100973	-20℃
  Single Use Library AdapterーSet A、96 rxns	100940	-20℃
  Single Use Library AdapterーSet B、96 rxns	100941	-20℃
  ResolveOME Bead Purification Kit	100772	4℃  毒

  ※ キット構成品単品での販売はございません

• Gonzalez-Pena et al.
  Accurate genomic variant detection in single cells with primary template-directed amplification. 
  PNAS (2021)

• Jeffrey R. Marks et al.
  Unifying comprehensive genomics and transcriptomics in individual cells to illuminate oncogenic and drug resistance mechanisms. 
  bioRxiv (2023)

• Changuk Chung et al.
  Cell-type-resolved somatic mosaicism reveals clonal dynamics of the human forebrain. 
  Nature (2024)

BaseJumperプラットフォームは、ResolveDNAあるいはResolveOMEで得られたデータのバイオインフォマティクス分析とインタラクティブな視覚化を大規模に実施するために設計されています。シングルセル全体のマルチオミクスデータの解析には、分子的特徴の相互作用を理解するための結果の整理とマッピングが必要です。BaseJumper は、計算から結果の解釈に時間をシフトさせ、スピードと使いやすさを提供します。

• 解析パイプライン
  
  • 二次解析
    DNA-QC, Whole Genome Sequencing, Whole Exome Sequencing, Expression
  • 三次解析
    Copy Number Variant (CNV), Structure Variant (SV), TMB, Variant Annotation, RNA Variant Calling
    など

ラインナップ

• BaseJumper Cloud
  無料でご利用いただけるクラウドベースのバイオインフォマティクスプラットフォームです。シーケンスリードのクオリティチェックおよびトランスクリプトーム解析が可能です。
• BaseJumper Local
  コンピューター/コンピュータークラスターにインストールして使用するコマンドラインベースのプラットフォームです。BaseJumperのすべての解析コンポーネントがご使用いただけます。
  ※Sentieonライセンスが必要です。
• BaseJumper Services
  ご要望に応じてBioSkryb社のバイオインフォマティクスチームが解析を実施します。

テクニカルノート

テクニカルノートのダウンロード